W dniach 21/22.06.2006 w firmie Mega SA przeprowadzony został audit w nadzorze nad funkcjonującym Zintegrowanym Systemem Zarządzania na zgodność z wymaganiami PN-EN ISO 9001:01, PN-EN ISO 14001:05 oraz AQAP 2120:03. Audit przeprowadzony został przez auditorów Zakładu Systemów Jakości i Zarządzania Ministerstwa Obrony Narodowej w siedzibie Mega SA oraz na realizowanych budowach. Podczas auditu nie wykazano niezgodności.